Tra le testimonianze più antiche c'è la chiesa di San Francesco, anche essa di epoca romanica e riedificata nel 1313.
La facciata ospita un portale gotico a tutto sesto sormontato da un timpano e decorato da colonnine tortili, datato 1429.
Nell'interno ad navata unica, con l'abside poligonale, la cappella “dell'Annunciazione” conserva affreschi di scuola umbro-marchigiana della seconda metà del Quattrocento, tra cui una Crocifissione e una Annunciazione. È presente anche un crocifisso ligneo duecentesco, testimonianza simbolica e mistica della cultura dell'ordine Benedettino.
Rilevante anche il chiostro con le lunette dipinte da Sebastiano Ghezzi, che illustrano le Storie della Vita di San Francesco e gli stemmi delle più importanti famiglie di Amandola.
Il campanile, sicuramente eretto grazie a maestranze lombarde, fu riportato allo stile originario nei lavori di restauro effettuati nel 1886.